سیستم ردیابی ژنتیکی برای ویروس های سرماخوردگی و آنفولانزا می تواند در مورد شیوع خطرناک هشدار دهد

هریسون می گوید: “برای اولین بار در تاریخ بشر، ژنومیک در مقیاس بزرگ به دولت ها و سیاست گذاران هشدارهایی در مورد آنچه قرار است در یک بیماری همه گیر رخ دهد، ارائه کرده است، و من فکر می کنم که این یک تغییر بازی واقعاً مهم و عمیق است.” این چیزی است که ما فکر می کنیم توسعه بیشتر آن واقعا مهم است.

برای خبرنامه رایگان بررسی سلامت ما ثبت نام کنید که اخبار سلامت، غذا و تناسب اندام را که می توانید به آنها اعتماد کنید، هر شنبه به شما می دهد.

تعیین توالی ده ها نوع ویروس مختلف که ممکن است در یک نمونه وجود داشته باشد، از نظر فنی چالش برانگیزتر از توالی یابی فقط یک نمونه است، به خصوص زمانی که هدف انجام این کار با استفاده از یک آزمایش ارزان قیمت باشد که می تواند در هر کجای دنیا مورد استفاده قرار گیرد. به همین دلیل است که هریسون و تیمش رویکرد خود را با استفاده از سواب‌های ذخیره‌شده قبل از شروع آزمایش سواب‌های تازه از بیماران بدحال در همکاری با آژانس امنیت بهداشتی بریتانیا اصلاح خواهند کرد. در بلندمدت، امید این است که نظارت فراتر از افراد مبتلا به بیماری جدی و سایر انواع ویروس ها گسترش یابد.

NIAID-RML/موسسه ملی بهداشت/عکس کتابخانه علمی

همچنین می تواند منجر به واکسن های بهتر شود. از آنجایی که توالی یابی SARS-CoV-2 نشان داد که انواع omicron در سرتاسر جهان گسترش یافته و غالب شده اند، شات های تقویت کننده mRNA به روز شد تا شامل دو نوع از این نوع باشد تا واکسن ها علیه آنها موثرتر شوند.

توالی یابی کل ژنوم یک ویروس اطلاعات بسیار بیشتری را نشان می دهد که می تواند از بسیاری جهات مفید باشد. برای شروع، می تواند به مردم کمک کند که موثرترین درمان ها را دریافت کنند. برخی از درمان های آنتی بادی برای کووید-19 ممکن است در برابر انواع جدیدتر موثرتر باشدبه عنوان مثال، بنابراین پزشکان می‌توانند فوراً درمان‌های جایگزین را انجام دهند، اگر بدانند فردی یکی از این انواع را دارد.

نمونه‌های ویروسی از افراد مبتلا به عفونت‌های تنفسی جدی، مانند آنفولانزا و RSV، در بریتانیا به طور منظم توسط توالی‌یابی DNA در پروژه‌ای آزمایش می‌شوند که می‌تواند منجر به درمان‌ها و واکسن‌های بهتر و همچنین هشدار اولیه در مورد اپیدمی‌های خطرناک جدید شود. این فناوری از پایان سال جاری روی سواب‌های بینی ذخیره‌شده حاصل از آزمایش‌های کووید-19 آزمایش می‌شود، قبل از اینکه سال آینده به طور گسترده‌تر عرضه شود.

تلاش جدید برای تعیین توالی سیستماتیک ژن های ویروس هایی که باعث عفونت های تنفسی جدی مانند آنفولانزا و RSV می شوند، می تواند به درمان ها و واکسن های بهتر منجر شود.

سلامتی


10 ژانویه 2023

توالی یابی ژنتیکی همچنین می تواند نحوه انتشار ویروس ها را نشان دهد و بنابراین به مهار آنها کمک می کند. بروئر می‌گوید، برای مثال، اگر فقط می‌دانید که دو نفر در بخش مراقبت‌های ویژه به عفونت رینوویروس مبتلا هستند، نمی‌دانید که آنها در بیمارستان یا در جامعه آلوده شده‌اند. تعیین توالی می تواند به ما بگوید که آیا دقیقاً همان ویروس را دارند یا خیر، و بنابراین آیا اقدامات کنترل عفونت بیمارستانی نیاز به بهبود دارد یا خیر.

در حال حاضر، محققان همچنین قصد دارند تمام مواد ژنتیکی موجود در تعدادی از نمونه‌های سواب را توالی‌بندی کنند. این رویکرد که به عنوان متاژنومیکس شناخته می شود، به آنها امکان می دهد تا انواع ویروس ها، باکتری ها و قارچ های موجود را شناسایی کنند و به آنها اجازه می دهد میکروبیوم دستگاه تنفسی را مطالعه کنند.

تصویر میکروسکوپ الکترونی از ذرات ویروس کرونا SARS-CoV-2

تصویر میکروسکوپ الکترونی از ذرات ویروس کرونا SARS-CoV-2

آخرین اما نه کم اهمیت، هریسون امیدوار است که بیماری های نوظهور جدید را در مراحل اولیه تشخیص دهد. اگر سایر کشورها نیز نظارت معمول ژنومی را انجام دهند، شانس دستیابی به این امر بسیار بیشتر خواهد بود.

در حالی که برای چندین دهه امکان توالی‌یابی ژنوم‌های ویروسی وجود داشت، تنها در طول همه‌گیری کووید-19 بود که بسیاری از کشورها شروع به توالی‌یابی سیستماتیک هزاران نمونه کردند، که نشان داد SARS-CoV-2، ویروس عامل بیماری، چگونه سریع‌تر تکامل می‌یابد. . به شرطی که. در میان چیزهای دیگر، این نظارت ژنومی به محققان اجازه می‌دهد اولین گونه‌های omicron را شناسایی کرده و به درستی پیش‌بینی کنند که باعث افزایش شدید موارد در سراسر جهان می‌شوند.

تیم پشتیبان این پروژه که ابتکار ویروس تنفسی و میکروبیوم نامیده می‌شود، می‌گوید که از برنامه‌های مشابهی در هیچ جای دنیا آگاه نیست، اما امیدوار است سایر کشورها نیز همین رویکرد را داشته باشند. برای تشویق این امر، همه روش‌ها و داده‌ها را آزادانه در دسترس قرار می‌دهد.

درباره این موضوعات بیشتر بدانید:


منبع: https://www.newscientist.com/article/2354051-genetic-tracking-scheme-for-viruses-could-warn-of-dangerous-outbreaks/?utm_campaign=RSS%7CNSNS&utm_source=NSNS&utm_medium=RSS&utm_content=homeمی‌گوید: «ما امیدواریم بتوان از آن در سراسر جهان استفاده کرد یوان هریسون در مؤسسه Wellcome Sanger در کمبریج، انگلستان، که این پروژه را رهبری می کند.

در حال حاضر، آزمایش‌هایی که معمولاً برای شناسایی ویروس‌های ایجادکننده عفونت‌های جدی استفاده می‌شوند، تنها نوع آن‌ها را نشان می‌دهند، مانند راینو ویروس یا آدنوویروس. جودیت برویرویروس شناس در دانشگاه کالج لندن.

او می‌گوید بسیاری از ویروس‌های دیگر مانند RSV نیز می‌توانند باعث عفونت‌های تنفسی جدی شوند، اما درک ما از این موارد بسیار محدود است. هریسون می‌گوید: «به‌جز مقدار کمی از توالی‌یابی ژنوم در موارد آنفولانزا، واقعاً هیچ نظارت ژنومی معمولی روی این ویروس‌های دیگر وجود ندارد.

برویر می‌گوید: «روش‌ها و فناوری‌های توسعه‌یافته توسط Ewan و Sangers بسیار مفید خواهند بود. “این یک ابتکار فوق العاده مهم است.”

توسط احمد گل کار

احمد گل کار