مرجع مجله: زیست شناسی میکرو انتشارات، DOI: 10.17912/micropub.biology.000654
یک دانش آموز 17 ساله دبیرستانی در کالیفرنیا ژنوم فرشته ماهی آب شیرین را تعیین توالی کرد.اسکالر پتروفیلوم) برای اولین بار.
Madireddy یک پرورش دهنده ماهی و زیست شناس مشتاق است و قبلاً با استفاده از ویرایش ژن CRISPR کار کرده است. او کالوین را از مرحله تخمک با دیگر نوزادان بزرگ کرده بود.
توالی یابی طی دو آخر هفته با یک توالی سنجی کوچک ساخته شده توسط Oxford Nanopore انجام شد. این توالیسنجها توالی مولکولهای DNA را هنگام عبور از منافذ ریز میخوانند.
او میگوید: «دیگر فرشتهماهیها همیشه در تانک من شاد و سالم هستند.
فرشته ماهی بومی حوضه آمازون است و به یک ماهی آکواریومی محبوب در سراسر جهان تبدیل شده است. ژنوم آن هیچ شگفتی خاصی را نشان نداد، زیرا مشابه ژنوم ماهی های مرتبط است.
Indeever Madireddy
توالیسنجیهای نانوحفره نسبت به روشهای رقیب کمی دقت کمتری دارند، اما میتوانند قطعات بسیار طولانیتری از DNA را توالییابی کنند. این کار باعث میشود نرمافزار توالییابی ژنوم را با کنار هم قرار دادن دوباره آنها در کنار هم قرار دهد – مانند یک پازل با قطعات بزرگتر و کمتر.
Madireddy سکانس را در BioCurieuxیک آزمایشگاه اجتماعی در سانتا کلارا، کالیفرنیا که تجهیزات پیشرفته ای را با هزینه کم در دسترس همه قرار می دهد.
Indeever Madireddy ژنوم فرشته ماهی خود کالوین را پس از مرگش در ماه مارس امسال تعیین توالی کرد. او می گوید: «اگرچه ماهی من مرده بود، اما می خواستم آن را برای همیشه نگه دارم. بنابراین تصمیم گرفتم ژنوم فرشته ماهی را توالی یابی کنم به این امید که بتوانم این اطلاعات را به جامعه علمی بیاورم و در عین حال ادای احترام کوچکی به حیوان خانگی خود داشته باشم!
Madireddy می گوید که تجزیه و تحلیل داده ها دو ماه دیگر و یادگیری بسیار بیشتری طول کشید. داده های توالی قرار داده شده است یک پایگاه داده عمومی و مقاله کوتاهی در توصیف کار در 18 اکتبر منتشر شد.
Indeever Madireddy، 17 ساله، ژنوم فرشته ماهی خانگی خود را پس از مردن توالی یابی کرد – اولین باری که این گونه توالی یابی شد.
زندگی
21 اکتبر 2022